1.丢失专票处理
根据《国家税务总局关于简化增值税发票领用和使用程序有关问题的公告》国家税务总局公告第19号一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联和抵扣联，如果丢失前已认证相符的，购买方可凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件及销售方主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》或《丢失货物运输业增值税专用发票已报税证明单》（附件1、2，以下统称《证明单》），作为增值税进项税额的抵扣凭证；如果丢失前未认证的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件进行认证，认证相符的可凭专用发票记账联复印件及销售方主管税务机关出具的《证明单》，作为增值税进项税额的抵扣凭证。专用发票记账联复印件和《证明单》留存备查。
2.丢失普票
根据真实性、相关性、合理性等税前扣除原则，企业丢失普通发票发票联后、确实无法取得原始扣除凭证的，必须向主管税务机关举证提供销货方存根联复印件和销货方销售货物入账凭证复印件以及该企业购货清单、入库单、款项支付证明等，由税务人员进行职业判断所得税税前扣除与否，必要时可下户核查确认。
来源：新疆国税12366
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